Una notte, lo studente liceale Sho Fukamachi scopre un misterioso oggetto metallico. Poi, in un lampo accecante di luce, Sho scopre di essersi accidentalmente fuso con il Guyver, un mecha dal misterioso design alieno. Ora, per salvare la sua ragazza, Mizuki Segawa, insieme al mondo intero, Sho deve diventare il Guyver per combattere la Chronos Corporation e le sue biocreature, chiamate Zoanoidi, che sono decise a dominare il mondo.
